Joana Gonçalves,

Universidade da Beira Interior –

Abstract:

A ferramenta BiGGEsTS – Biclustering Gene Expression Time-Series, tem
como objectivo a integração de algoritmos de biclustering para análise de
séries temporais de expressão genética. Estes algoritmos abordam o problema
de biclustering em dados provenientes de séries temporais de expressão genética
de forma directa, isto é, permitem identificar biclusters formados por um conjunto de genes
com expressão coerente num subconjunto contíguo dos instantes temporais em análise.
Os biclusters identificados poderão posteriormente ser visualizados e estudados
usando a aplicação, e segundo várias dimensões de análise, de forma a identificar
aqueles que são relevantes do ponto de vista biológico e podem depois ajudar
na identificação de módulos regulatórios.

Embora existam já ferramentas que integram algoritmos de biclustering aplicados
a dados de expressão genética em geral, o desenvolvimento de uma ferramenta
para o caso específico das séries temporais, dada a particularidade dos algoritmos
e biclustering integrados e dos resultados obtidos é inovador.

Neste seminário será apresentada a versão actual da ferramenta e discutidas
direcções para trabalho futuro.

 

Date: 2007-Mar-01     Time: 16:00:00     Room: 336

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